Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL1Q11201 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms