Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG1Q06432 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms