Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms