Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms