Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAV1Q03135 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms