Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms