Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms