Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms