Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms