Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK17Q00537 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK17Q00537 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms