Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VLDLRP98155 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms