Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K9P80192 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K9P80192 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K9P80192 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K9P80192 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MAP3K9P80192 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MAP3K9P80192 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms