Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL7P80098 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms