Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPL23P62829 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL23P62829 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms