Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARF3P61204 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARF3P61204 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF3P61204 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF3P61204 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF3P61204 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF3P61204 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms