Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN8P56748 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN8P56748 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms