Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUCLG1P53597 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms