Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms