Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGDP52209 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGDP52209 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGDP52209 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGDP52209 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms