Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTAP49354 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTAP49354 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms