Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms