Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPOP42166 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPOP42166 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPOP42166 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPOP42166 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms