Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms