Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDAP32320 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDAP32320 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDAP32320 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms