Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L1CAMP32004 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms