Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms