Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERP29P30040 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERP29P30040 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms