Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms