Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms