Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms