Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms