Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF1P21675 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1P21675 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF1P21675 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms