Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CXCL3P19876 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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