Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSPP15924 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSPP15924 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms