Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms