Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DOBP13765 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms