Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms