Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTXN2P0C2S0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTXN2P0C2S0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms