Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF1P09603 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF1P09603 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF1P09603 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF1P09603 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF1P09603 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF1P09603 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms