Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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