Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APODP05090 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APODP05090 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APODP05090 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APODP05090 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APODP05090 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms