Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRB1P04280 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRB1P04280 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRB1P04280 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRB1P04280 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms