Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms