Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms