Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF6O75683 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms