Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms