Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TLR5O60602 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TLR5O60602 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TLR5O60602 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TLR5O60602 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TLR5O60602 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TLR5O60602 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR5O60602 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR5O60602 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms