Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTATSF1O43719 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTATSF1O43719 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTATSF1O43719 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTATSF1O43719 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms