Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms