Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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HOXA3O43365 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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